Все события происходят в средние века вокруг нового Римского папы Родриго Борджиа, это представитель самого знатного и влиятельного семейства во всей Европе. Они издавна известны своей любовью к власти, деньгам и конечно бесперебойному сексу.

Целых два поколения Пап вышли из этой семьи, но пришли они к власти использую подкупы, убийства, мошенничества и угрозы. Нет другой такой семьи как сериал Борджиа 3 во всей стране, кто мог бы им противостоять или перечить.

Но у нового папы появился настоящий ненавистник, это кардинал Ровере, он хочет скинуть действующего папу и для этого собирает вокруг себя его противников. Более того, Ровере сумел подговорить самого французского короля на свержение Родриго Борджиа, теперь армия французов идет войной на Рим.